@MASTERSTHESIS{ 2025:1237359448,
 	title = {Análises in silico da família ABC transporters em feijão comum},
 	year = {2025},
 	url = "http://sistemas2.uespi.br/handle/tede/1627",
 	abstract = "O feijão comum (Phaseolus vulgaris L.) é uma leguminosa de importância mundial. Entretanto, seu cultivo é afetado por estresses bióticos e abióticos. As proteínas transmembranas ABC transporters (ATP-binding cassette) desempenham um papel fundamental na resposta de tolerância das plantas a estresses. Apesar disso, pouco é conhecido a respeito dos ABC transporters em feijão comum. Desse modo,  objetivou-se a identificação e caracterização in silico dos genes e proteínas PvABC (ABC transporters de P. vulgaris). Para a identificação das proteínas, ABC transporters de Arabidopsis thaliana foram submetidos a um BLASTp (e-value < e-10) no proteoma de P. vulgaris alocado no NCBI. As sequências peptídicas identificadas foram submetidas ao HMMER e no InterProScan para confirmação de domínio. Os pesos moleculares e pontos isoelétricos, além de hélices transmembranas, motivos conservados e localização subcelular, foram preditos nos softwares ExPASy, TMHMM, MEME, DeepLoc e Wolf PSORT, respectivamente. Para a análise filogenética foram utilizados os software MAFFT e IQTree. Os genes PvABC foram caracterizados quanto às estruturas exon-íntron  pelo GSDS e a localização cromossomal via TBtools. As sequências promotoras dos genes PvABC foram submetidas ao PlantCARE para prever os elementos cis-regulatórios. No total, foram identificadas 180 proteínas ABC (tamanho entre 72 e 1.945 aa) correspondentes a 164 genes de P. vulgaris. O ponto isoelétrico das proteínas PvABC variou de 5,57 (PvABCI114) a 10,86 (PvABCI162), enquanto o peso molecular oscilou de 7.919,25 (PvABCC134) a 210.122,4 Da (PvABCB58). A predição de hélices transmembranas revelou a presença de 0 a 17 hélices, sendo que a maioria das proteínas PvABC tem 06 hélices transmembranas e foram preditas, principalmente, na membrana plasmática. A análise no MEME revelou 10 motivos conservados na família PvABC, com o motivo 01 sendo o mais conservado estando presente em 157 (87,2%) das proteínas PvABC. A análise filogenética distribuiu as proteínas PvABC em 07 subfamílias, PvABCA (06), PvABCB (32), PvABCC (32), PvABCD (05), PvABCF (07), PvABCG (80) e PvABCI (18). A localização cromossômica revelou 161 genes PvABC distribuídos nos 11 cromossomos de P. vulgaris, com exceção de um gene mitocondrial (PvABCI162) e dois genes (PvABCC163 e PvABCG164) com locus não identificado. O cromossomo 01 teve o maior número de genes mapeados, com 38 genes PvABC. O número de éxons e íntrons variou, respectivamente, entre 1 – 36 e 0 – 35. Identificou-se 112 elementos cis-regulatórios nas regiões promotoras dos 162 genes PvABC, sendo que 49 elementos foram categorizados em três grupos funcionais: elementos responsivos a estresses (07), elementos responsivos a hormônios (12) e elementos responsivos à luz (30). Alguns dos principais elementos cis-regulatórios identificados foram os elementos envolvidos na indução anaeróbica (ARE), ABRE e Box 4. Diversos estudos realizados em outras espécies de plantas revelam uma variedade de funções das proteínas ABC, relacionadas ao desenvolvimento e tolerância a estresses. Portanto, nossos resultados fornecem uma base para pesquisas adicionais sobre a função dos genes PvABC com potencial para aplicação no melhoramento genético de P. vulgaris.",
 	publisher = {Universidade Estadual do Piauí},
 	scholl = {Licenciatura em Ciências Biológicas},
 	note = {Centro de Ensino - Campus do Interior}
}