@MASTERSTHESIS{ 2025:1850470226, title = {Caracterização in silico da família MC (Mitochondrial carrier) em Phaseolus vulgaris}, year = {2025}, url = "http://sistemas2.uespi.br/handle/tede/2382", abstract = "O feijão comum (Phaseolus vulgaris L.) é uma leguminosa de grande importância econômica, amplamente cultivada e consumida em várias regiões do mundo. No entanto, seu cultivo enfrenta desafios devido à exposição a diversos tipos de estresses, como seca, salinidade e pragas, que podem comprometer sua produtividade e qualidade. A família gênica de transportadores MC (Mitochondrial carrier) é essencial na resposta das plantas a estresses abióticos, como seca, salinidade e frio. No entanto, há uma carência de informações sobre a família MC em P. vulgaris. Assim, objetivou-se identificar e caracterizar genes e proteínas MC no genoma e proteoma do feijão comum utilizando ferramentas de bioinformática. A identificação dessas proteínas ocorreu via BLASTp (e-value < e-10) no proteoma de P. vulgaris alocado no NCBI. As sequências peptídicas identificadas foram analisadas no HMMER e InterProScan para confirmação do domínio proteico. O peso molecular e ponto isoelétrico foram determinados no ExPASy, enquanto a localização subcelular ocorreu no DeepLoc. A caracterização gênica envolveu a determinação do número de exons e a localização cromossômica foi realizada via NCBI e TbTools, os motivos proteicos foram preditos no MEME. Já a análise filogenética com as proteínas MC de A. thaliana e P. vulgaris foi feita nos softwares MAFFT e IQTree. Foram identificadas 80 proteínas PvMC (tamanho entre 127 e 812 aa), correspondentes a 74 genes de P. vulgaris. O peso molecular alternou entre 14100,39 (PvMC 64) a 39790,21 Da (PvMC 4) e o ponto isoelétrico variou de 5,44 (PvMC 61a) a 9,99 (PvMC 25). A maioria das proteínas PvMC (97,5%) é encontrada na mitocôndria, embora uma foi prevista ocorrendo no peroxissomo e outra no plastídeo. Os genes PvMC possuem de 1 a 13 éxons e estão distribuídos em todos os cromossomos de P. vulgaris. O número de genes por cromossomo variou de 3 (cromossomo 11) e 14 (cromossomo 2). As PvMC tiveram entre 0 e 8 regiões transmembranas. Na análise do MEME foram identificados 10 motivos conservados, sendo os motivos 2, 1 e 3 os mais conservados e o motivo 10 o menos conservado. A análise filogenética foi feita utilizando 74 proteínas MC de P. vulgaris e 25 proteínas MC caracterizadas de A. thaliana. Na árvore filogenética as proteínas foram divididas em quatro subfamílias principais: nucleotídeos e dinucleotídeos; di-/tri-carboxilatos e cetoácidos; aminoácidos; e outros substrato e subdividida em 10 subgrupos: AAC, APC, NDT, ORNITHINE, DIC, DTC, UCP, SFC, SAMC e MRS. Vários MCs caracterizados de A. thaliana e outras espécies estão envolvidos em funções essenciais bem como na resposta das plantas a estresses bióticos e abióticos. Assim, a identificação e caracterização da família MC aqui apresentada, fornece informações úteis aos programas de melhoramento de P. vulgaris.", publisher = {Universidade Estadual do Piauí}, scholl = {Licenciatura em Ciências Biológicas}, note = {Centro de Ensino - Campus do Interior} }